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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

香港特首李家超：确保今年内带领香港脱离疫情困扰******

　　中新社香港1月1日电 (记者 韩星童)香港特区行政长官李家超1日发表新年贺词，表示特区政府今年有两大目标，包括确保今年内带领香港脱离疫情困扰，以及全力落实在新一份施政报告中提出的各项工作。

　　李家超表示，回顾2022年，香港谱写了新篇章，疫情下社会稳步复常，不少国际盛事及大型活动在香港有序安全进行，整体社会气氛越来越好。展望新一年，他希望香港将迎来更加丰盛的2023年。

　　李家超提到，特区政府在新一年有两大目标，其一便是让市民的生活尽量完全恢复至疫情前的正常情况。随着特区政府早前优化防疫措施，只维持“口罩令”，取消社交距离限制，再逐步有序全面“通关”，经济活动将会快速恢复，预计消费需求将会上升很多，各行各业对前景感到乐观，正积极增聘人手，准备捕捉经济复苏的良机。

　　李家超说，香港在背靠内地，联通世界的优势下，在国际舞台上再次发光发亮，成为连接内地和世界的桥梁。他与管治团队会竭尽所能，推动社会各项民生、经济活动，确保在今年内带领香港脱离疫情困扰，恢复正常。

　　另外，李家超也表示，特区政府会全力落实在新一份施政报告中提出的各项工作，增强发展动能，排解民生忧难，建立健康、充满活力、关爱共融的宜居香港，并推动青年发展及教育，实现新飞跃。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）